دپارتمان برنامه‌ریزی روستایی، منطقه‌ای و فضایی با هدف توسعه متوازن و پایدار فضاهای جغرافیایی فعالیت می‌کند. این بخش با بهره‌گیری از داده‌های مکانی، مطالعات میدانی و مدل‌سازی‌های تحلیلی، به طراحی الگوهای بهینه استقرار جمعیت و فعالیت می‌پردازد. تدوین طرح‌های هادی و توسعه‌ روستایی، آمایش سرزمین، و برنامه‌ریزی کاربری زمین بعضی از محورهای عملکرد این دپارتمان است. تمرکز بر مشارکت‌پذیری جوامع محلی و انطباق با سیاست‌های کلان توسعه، از ویژگی‌های خدمات این بخش می‌باشد.